La recherche antigénique de Rotavirus et Adénovirus est remplacée par une technique de biologie moléculaire plus sensible. La technique par PCR multiplex permet de détecter cinq virus pouvant être responsables de GEA : Rotavirus, Adénovirus, Sapovirus, Astrovirus humain et Norovirus.
Cet examen est réservé à la pédiatrie ou peut être réalisé chez l'adulte dans un contexte d'épidémie nosocomiale de GEA ou chez un patient immunodéprimé.